武漢華大基因技術(shù)服務(wù)有限公司鄧天全獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉武漢華大基因技術(shù)服務(wù)有限公司申請(qǐng)的專利一種使用短讀長序列糾錯(cuò)長讀長組裝結(jié)果的方法和裝置獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號(hào)為:CN113012758B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-06-17發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為:202110452532.9,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B30/00;該發(fā)明授權(quán)一種使用短讀長序列糾錯(cuò)長讀長組裝結(jié)果的方法和裝置是由鄧天全;楊林峰設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2021-04-26向國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。
本一種使用短讀長序列糾錯(cuò)長讀長組裝結(jié)果的方法和裝置在說明書摘要公布了:本申請(qǐng)公開了一種使用短讀長序列糾錯(cuò)長讀長組裝結(jié)果的方法和裝置。本申請(qǐng)的方法包括,切割步驟,以固定閾值對(duì)長讀長組裝結(jié)果進(jìn)行切分,獲得切分后的長讀長組裝結(jié)果;以及后續(xù)的基于切分后的長讀長組裝結(jié)果進(jìn)行的長讀長組裝結(jié)果建庫步驟、比對(duì)步驟、比對(duì)結(jié)果匹配步驟、比對(duì)結(jié)果轉(zhuǎn)換和排序步驟、比對(duì)結(jié)果建庫步驟、長讀長組裝結(jié)果糾錯(cuò)步驟,最終合并糾錯(cuò)結(jié)果,獲得糾錯(cuò)后的長讀長組裝結(jié)果。本申請(qǐng)的方法,可使用小內(nèi)存節(jié)點(diǎn)進(jìn)行糾錯(cuò),大幅降低了內(nèi)存峰值,解決沒有大內(nèi)存節(jié)點(diǎn)無法進(jìn)行糾錯(cuò)的問題,降低了長度長組裝結(jié)果的糾錯(cuò)成本;并且,在資源充足情況下,本申請(qǐng)的糾錯(cuò)方法和裝置還可以并行執(zhí)行,降低執(zhí)行時(shí)間,提供糾錯(cuò)效率。
本發(fā)明授權(quán)一種使用短讀長序列糾錯(cuò)長讀長組裝結(jié)果的方法和裝置在權(quán)利要求書中公布了:1.一種使用短讀長序列糾錯(cuò)長讀長組裝結(jié)果的方法,其特征在于:包括以下步驟, 切割步驟,包括以固定閾值對(duì)長讀長組裝結(jié)果進(jìn)行切分,獲得切分后的長讀長組裝結(jié)果; 長讀長組裝結(jié)果建庫步驟,包括對(duì)切分后的長讀長組裝結(jié)果進(jìn)行建庫,獲得切分后的長讀長組裝結(jié)果庫; 比對(duì)步驟,包括將短讀長序列比對(duì)到所述切分后的長讀長組裝結(jié)果庫中,獲得比對(duì)結(jié)果; 比對(duì)結(jié)果匹配步驟,包括將所述比對(duì)步驟獲得的比對(duì)結(jié)果匹配到所述切分后的長讀長組裝結(jié)果庫中,獲得含有匹配信息的比對(duì)結(jié)果; 比對(duì)結(jié)果轉(zhuǎn)換和排序步驟,包括將所述含有匹配信息的比對(duì)結(jié)果轉(zhuǎn)換成bam格式,并排序; 比對(duì)結(jié)果建庫步驟,包括對(duì)排序后的轉(zhuǎn)換成bam格式的比對(duì)結(jié)果進(jìn)行建庫,獲得比對(duì)結(jié)果庫; 長讀長組裝結(jié)果糾錯(cuò)步驟,包括采用所述比對(duì)結(jié)果庫對(duì)所述切分后的長讀長組裝結(jié)果庫進(jìn)行糾錯(cuò),獲得糾錯(cuò)結(jié)果; 合并糾錯(cuò)結(jié)果步驟,包括合并糾錯(cuò)結(jié)果,獲得糾錯(cuò)后的長讀長組裝結(jié)果。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請(qǐng)人或?qū)@麢?quán)人武漢華大基因技術(shù)服務(wù)有限公司,其通訊地址為:430075 湖北省武漢市武漢東湖新技術(shù)開發(fā)區(qū)高新大道666號(hào)武漢國家生物產(chǎn)業(yè)基地項(xiàng)目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B2棟;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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